Valná hromada je hlavním kontrolním orgánem Centra. Každá instituce v konsorciu NCK MATCA má ve Valné hromadě jednoho zástupce. O dění v Centru je Valná hromada informována nejméně dvakrát ročně na pravidelných zasedáních.
Generální manažer shrnul členům Valné hromady činnost Centra za minulý rok a seznámil je s rozšířenou vizí jejího působení a propagace v blízké budoucnosti.
Dne 29.6.2020 se konalo první letošní zasedání Valné hromady. Zasedání bylo věnované rekapitulaci činnosti Centra a především jeho plánům do budoucna. Členové Valné hromady byli seznámeni s výroční zprávou a účetní závěrkou.
Dne 6.12. 2019 se konalo druhé letošní zasedání valné hromady. Kromě informací o dění v Centru a plánech na příští rok zazněly i prezentace společností Beneš a Lát a CARDAM.